用戶管理是商業網站的重要職能，在以用戶為中心的模式下，幾乎整個企業的運轉就是為了滿足用戶的需求，而網站是電子商務行為發生的平臺，因而很難將用戶管理與電子商務的信息系統、營銷系統、支付系統、物流系統割裂開，與商業活動脫離后，用戶管理不但是不完整的，而且沒有活力。但若面面俱到，那將遠遠超出網站建設的范疇，因而本節只能先對用戶管理中純與網站建設有關而對商業活動涉及較少的部分進行講述，然后再對作為其他商務系統界面的客戶管理部分做簡單介紹。

（1）用戶注冊管理
實行用戶注冊是多數網站管理的基本手段，對于注冊用戶可享受更細致、更個性化的服務，為收費服務奠定基礎。對網絡用戶的注冊，在安裝了適合的軟件后，基本上不需要管理人員的參與，涉及到收費的用戶，需對注冊信息進行人工檢查，使其能為后來的活動負責。
（2）用戶信息反饋管理
用戶信息反饋的管理是指用戶信息的收集、分析評價、分類存儲與響應處理，這一點前面已經介紹過。
（3）用戶活動管理
用戶活動管理的目的是使用戶的活動符合法律規范和社會道德的要求。另外，要使用戶的行為符合規程，以便更好地保持網絡的高性能，防止用戶的不當操作影響整個網絡的可用性。為了實現規范用戶活動的目的，網站要做許多工作。比如，有留言板的頁面，在用戶注冊時要明確用戶應該接受的條件，如不能發表反動的、污辱人的、有損社會公德的言論，不能加入與此相關內容的鏈接與圖片等。有個人主頁的，則應要求不能提供國家明令禁止的內容與服務等。為防止用戶不當操作影響網站可用性，網站可進行一些限制，比如對發送的最大郵件的限制，對粘貼的最大圖片的限制，在聊天室里對不能重復發送同一段話的限制，對打開同一程序的人數的限制等。